Furan prsten u 5-hidroksimetilfurfuralni (HMF) značajno doprinosi njegovoj reaktivnosti jer je to struktura bogata elektronom. Atom kisika u prstenu furan može djelovati kao nukleofil i lako sudjelovati u reakcijama elektrofilne supstitucije s različitim elektrofilima poput kiselina, alkalija ili metalnih iona. Ovo svojstvo čini HMF vrlo reaktivnim u katalitičkim procesima, poput onih u biokemijskim pretvorbama ili reakcijama polimerizacije. Furan prsten također čini HMF vrijednim prethodnikom u proizvodnji kemikalija koje se temelje na biofuljima, kao biogora, bioplastike ili spojeva okusa, zbog svoje sposobnosti da prođe reakcije ili preuređenja otvaranja prstena. Međutim, visoka reaktivnost prstena furan također može dovesti do nuspojava u industrijskim procesima, poput stvaranja polimera ili stvaranja nepoželjnih nusproizvoda, posebno u teškim uvjetima reakcije.
Prisutnost hidroksimetilne skupine (-CH2OH) pričvršćena na prsten furan daje nekoliko ključnih karakteristika koje utječu na reaktivnost i stabilnost HMF-a. Ova polarna funkcionalna skupina pojačava topljivost HMF-a u polarnim otapalima poput vode i alkohola, što je važno u reakcijama vodene faze koje se obično koriste u procesima biorefiniranja. Hidroksimetilna skupina također može formirati vodikove veze, promičući interakciju HMF -a s drugim polarnim molekulama, poput vode ili reaktivnih intermedijara u katalitičkim reakcijama. Ova interakcija može povećati brzinu reakcija poput hidrolize, hidrogenacije ili kondenzacije, olakšavajući pretvorbu HMF-a u druge proizvode s dodanom vrijednošću poput levulinske kiseline ili furfuralne. Međutim, ta ista funkcionalnost čini HMF osjetljivim na oksidaciju u prisutnosti oksidirajućih sredstava, gdje se hidroksimetilna skupina može pretvoriti u aldehid (-CHO) ili čak u skupinu karboksilne kiseline (-COOH). Ova oksidativna razgradnja može smanjiti prinos i učinkovitost procesa koji uključuju HMF, posebno u prehrambenoj ili kemijskoj primjeni gdje je stabilnost presudna.
U specifičnim uvjetima, posebno u prisutnosti kiselih ili oksidativnih sredstava, hidroksimetil skupina u HMF-u može se oksidirati u aldehidnu skupinu (-CHO), što rezultira stvaranjem 5 formilfurana i drugih produkata razgradnje. Aldehidna skupina vrlo je reaktivna, sposobna sudjelovati u nukleofilnom napadu spojeva poput amina, alkohola ili šećera, što može dovesti do stvaranja umreženih polimera ili kondenzacijskih proizvoda. Iako je skupina aldehida ključna funkcionalnost u sintezi različitih kemikalija visoke vrijednosti, uključujući plastiku i okuse utemeljene na biološkoj biološkoj, također može dovesti do neželjenih reakcija, smanjujući prinos ciljnih proizvoda. U industrijskim procesima gdje je cilj održati integritet HMF-a, kontrola oksidacije hidroksimetilne skupine ključno je za sprečavanje stvaranja prekomjernih aldehida, što bi moglo rezultirati nižim kvalitetnim nusproizvodima i smanjenom učinkovitošću procesa.
HMF pokazuje relativno lošu stabilnost u kiselom okruženju, gdje je vrlo osjetljiv na degradaciju. Kiseli uvjeti korišteni u industrijskim procesima kao što su pretvorba biomase, proizvodnja biogoriva ili kemijska sinteza mogu uzrokovati da HMF prođe polimerizaciju, dehidraciju ili izomerizaciju. Pod jakim kiselim katalizatorima (npr. Sumporna kiselina), HMF može proći hidrolizni slom, što rezultira stvaranjem nusproizvoda poput levulinske kiseline ili furfuralnih, što može biti nepoželjno ovisno o namjeravanoj primjeni. Kisela okruženja promiču dehidraciju HMF-a, što dovodi do stvaranja smola ili polimernih nusproizvoda. Ove sporedne reakcije ne samo da smanjuju prinos željenih proizvoda, već mogu otežati kontrolu i manje učinkovite, što zahtijeva više koraka usavršavanja i što dovodi do većih operativnih troškova. Održavanje optimalnog pH raspona je presudno kada se koristi HMF u procesima kako bi se spriječila neželjena degradacija i osigurala visok prinos proizvoda.